Menurut SK Mendikbud. No. 0174/0/1995 Perpustakaan Universitas Negeri Yogyakarta (UNY) berkedudukan sebagai Unit Pelaksana Teknis di bidang perpustakaan yang berada di bawah dan bertanggung jawab langsung kepada Rektor yang sehari-hari pembinaanya dilakukan oleh Pembantu Rektor

Perpustakaan bertugas memberikan pelayanan bahan rujukan dan informasi untuk keperluan pendidikan dan pengajaran, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat. Untuk penyelenggarakan tugas tersebut perpustakaan mempunyai fungsi menyediakan dan mengolah bahan pustaka, memelihara bahan pustaka, melakukan pelayanan, dan melakukan tugas tata usaha perpustakaan.

Sesuai dengan kedudukannya sebagai UPT, Perpustakaan Universitas Negeri Yogyakarta berada di bawah dan bertanggungjawab langsung kepada Rektor. Adapun pembinaan seharĂ­-harinya dilakukan oleh Pembantu Rektor 1. UPT Perpustakaan Universitas Negeri Yogyakarta berdasarkan SK Mendikbud 0174/0/1995 terdiri atas Kepala Perpustakaan, Kepala Subag Tata Usaha Perpustakaan, dan Kelompok Pustakawan.

Perpustakaan dipimpin oleh seorang Kepala yang ditunjuk diantara pustakawan senior dilingkungan perpustakaan. Sedang Kelompok Pustakawan terdiri dari sejumlah pustakawan dalam jabatan fungsional yang dipimpin seorang pustakawan senior yang ditunjuk diantara tenaga pustakawan dilingkungan perpustakaan. Dalam melaksanakan tugasnya kegiatan layanan perpustakaan disalurkan melalui 5 koordinator kegiatan sebagai berikut

Koordinator Layanan Teknis, meliputi kegiatan-kegiatan:

  1. Seleksi Bahan Pustaka
  2. Seleksi Bahan Pustaka
  3. Pengadaan Bahan Pustaka
  4. Inventarisasi Bahan Pustaka
  5. Klasifikasi/Tajuk Subyek
  6. Deskripsi Katalog
  7. Pasca Katalog
  8. Perawatan Bahan Pustaka

Koordinator Layanan Pemakai, meliputi kegiatan-kegiatan:

  1. Pengadministrasi Keanggotaan
  2. Layanan Sirkulasi
  3. Layanan Referensi dan Informasi
  4. Layanan Baca

Koordinator Layanan Khusus, meliputi kegiatan-kegiatan:

  1. Layanan Pendidikan Pemakai
  2. Layanan Penerbitan
  3. Statistik

Koordinator Teknologi Informasi, kegiatannya meliputi:

  1. Pengelolaan hardware
  2. Pengelolaan software
  3. Pengelolaan Web

Koordinator Kerjasama, kegiatannya meliputi:

  1. Kerjasama dengan perpustakaan di seluruh D.I. Yogyakarta.
  2. Kerjasama dengan sesama perpustakaan perguruan tinggi negeri di seluruh Indonesia
  3. Kerjasama dengan Perpustakaan perguruan tinggi luar negeri